上海科学技术出版社出版科学、工业、农业、医学、教育等领域的专著、基础理论书、工具书、技术参考书、科普读物和教材，具有门类齐全、品种多样、层次丰富的特点，得到社会的肯定和读者的认可。

1995年至今，有《半导体超晶格物理》、《中国医学百科全书》、《肿瘤的诱导分化和凋亡疗法》、《高温超导基础研究》、《科学与艺术》、《超级杂交稻研究》、《中华本草》、《药学大辞典》、《中国医籍大辞典》、《国家最高科学技术获奖人丛书（第一辑）》、《热河生物群》、《彩图科技百科全书》、《中药大辞典》（第二版）、《电子晶体学与图像处理》等80多种图书获国家级图书奖。2014年，《上海世博会建设丛书》、《植物激素作用的分子机理》和《大众医学》杂志获得第三届中国出版政府奖提名奖。“十二五”国家重点出版规划项目和历年获国家出版资助项目数在全国出版社中名列前茅。     

上海科学技术出版社以出版自然科学、工程技术、医学卫生、实用读物以及科普类等书刊为主要特色，是中宣部和新闻出版总署首批命名的“全国优秀出版社”之一，2009年被总署授予“全国百佳图书出版单位”称号，2010年荣获首批“全国新闻出版行业文明单位”称号。2011年获“第二届中国出版政府奖先进出版单位奖”，并获上海市文明单位（2007—2016年）等称号，2017年荣获全国文明单位称号。